我国是一个发展中的农业大国，只有农业发展了国家才能够全面进步，一直以来农业都制约着国家经济的发展，所以我国非常重视农业的发展。2009年初，国务院正式公布的2009年中央一号文件再度锁定“三农”，这也是首次连续6年发布关于“三农”工作的一号文件。在中国，农业发展不仅引起了政府部门的高度重视，也引起了企业家们的热切关注。而以农业发展为基础前提的生物燃料更是成了投资焦点，尤其是第二代生物燃料凭着“不与粮争地”，“不与人争食”的优势，正成为未来生物能源产业发展的方向。
中国科学院一个实验室研制出一项最新科技成果，可以将木屑、稻壳、玉米秆和棉花秆等多种原料进行热解液化和再加工，将它们转化为生物燃料。据统计，中国目前能够规模化利用的生物燃料油木本植物有10种，这10种植物都蕴藏着盛大潜力。丰富的植物资源，使中国生物燃油的前景非常光明。
柯铭就曾表达了他对中国市场的乐观。他说，中国收集农作物废料的人力成本具有巨大竞争力，且发展以秸秆为原料的第二代生物燃料还有利于农民的增收和农村经济的发展。他认为：“中国很可能在全球范围内率先实现第二代生物燃料的大规模生产和推广。”
中国除了进行以木本植物为原料的实验外，还扩大了粮食原料的实验范围，探索以低产农田和较恶劣环境种植的作物为原料，并在一些技术上取得了突破。截至2008年8月，全球有超过40个纤维素乙醇示范项目，而国内至少有三个非粮食乙醇项目已经进入示范阶段。
中国的木质纤维素储量丰富，可以在非粮食耕作土地上，利用林作物的废弃物，甚至垃圾生产纤维素乙醇燃料。因此，第二代生物燃料的发展对中国车用能源来说，将起到极大的推进作用。中国是世界率先应用可替代能源动力推进系统的最佳市场。
不过，即使是第二代生物燃料，也仍然有它的弱点。首先是第二代生物燃料还处于发展的初级阶段，目前国家并没有出台相关扶持政策；第二，大规模生产的问题。第二代生物燃料的一些关键工艺涉及一系列复杂过程和技术，需要很大的投资和大量的原材料，要实现工业化生产还需经历一个漫长的过程；第三，成本问题。因为生物质原料极其分散，采集成本、运输成本和生产成本都可能成为制约燃料乙醇业发展的瓶颈；另外，国际油价持续下跌，会使人们简单地返回旧的生活习惯，进一步加大第二代生物燃料的推广难度。
虽然有弱点但是第二代生物燃料代表着生物燃料的发展方向，在中国的发展潜力将会很大。
